國家海洋局第二海洋研究所創(chuàng)建于1966年，是一座綜合型公益性海洋研究機構。主要職能是從事海洋基礎研究、應用基礎研究和高新技術研究，促進海洋科技進步，為海洋管理、公益服務、海洋經濟發(fā)展及海洋安全提供科技支撐。作為國內從事海洋調查與研究的主要單位之一，建有一個國家重點實驗室、三個國家海洋局開放實驗室以及一個所級重點實驗室。擁有與國際接軌的、可用于近岸到深海海洋調查研究所需的、總價值上億元的多專業(yè)內外業(yè)儀器設備。2014年海洋二所與舟山市政府聯合組建的“國海舟山海洋科技研發(fā)基地”，基地占地55畝、占用岸線300米、建設5000噸級碼頭泊位2個，位于舟山長峙島毗鄰浙江海洋大學，擬建設成為集深?？茖W研究、海洋資源開發(fā)與環(huán)境保護、技術研發(fā)與裝備制造為一體的科研基地。